在新的《中华人民共和国刑法》中，变造公司债券罪的具体判定规则如下：
首先，只要行为人触犯了该项罪名，通常会被判处三年以下有期徒刑或拘役，同时还必须处以或者仅处以1至10万元的罚金。
其次，如果行为人的犯罪数额达到了法律所定义的“巨大”标准，那么将会被判决三年以上十年以下有期徒刑，并同时处以2到20万元的罚金。
最后，值得注意的是，如果是单位犯下此种罪行的话，不仅要对相关单位进行罚款的处罚，而且还要按照个人犯罪的条款对他们的主要责任人进行相应的惩罚。

《刑法》第一百七十八条
伪造、变造股票或者公司、企业债券，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。
单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前两款的规定处罚。