1、刑事案件在不起诉的情况下当然不会有案底，
2、检察院提起公诉后，经人民法院的审理确认当事人是有罪的，才会有案底，如果检察院没有提起公诉，在法律层面上来讲，当事人就不构成犯罪，既然不构成犯罪，自然不会有案底。

《中华人民共和国刑事诉讼法》
第十六条有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的;
(二)犯罪已过追诉时效期限的;
(三)经特赦令免除刑罚的;
(四)依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的;
(五)犯罪嫌疑人、被告人死亡的;
(六)其他法律规定免予追究刑事责任的。