在实施农村地区光伏发电系统拆卸工程时，应严格遵循国家相关法律法规进行合理补偿。
具体措施如下：
方案一：
按照设备整体价款的百分之八十至百分之百的比例给予赔偿，然而，被拆解的家用型光伏电站设备需由产权人自行安排处置事宜，既可作为二手设备出售，亦能选择异地重新安装。
方案二：
依照设备总体价值的1.2到1.5倍的标准予以赔偿，值得注意的是，这类家用型光伏电站设备将会被拆除并取走。
无论选择哪种方式，补偿金额均应以安装成本与预期收益之和的百分比进行计算，且所幸，被拆卸设备可由业主自主支配处理。
无论是选择出售还是继续使用，均可实现经济效益最大化。需要指出的是，上述两种方案中的补偿金额相较之下较为有限，但却为业主提供了继续利用光伏设备剩余价值、获取更多盈利的可能。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条
作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
（一）被征收房屋价值的补偿；
（二）因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
（三）因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。
市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。