完全可以进行报销操作。通常情况下，患者在完成住院治疗后或在出院、转换医院等环节后，才能够进行医保报销。无论是否已经成功报销医保，均不会对其向法院提起诉讼的合法权益产生任何影响。
然而，若当事人决定向法院提起诉讼，则应自觉退还已由医保机构报销的相关医疗费用。否则，事后医保报销单位仍有权向当事人追偿。

《工伤保险条例》第三十三条
职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
停工留薪期一般不超过12个月。
伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。
工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有关规定享受伤残待遇。
工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇。
生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。