要扣分的。

摩托车违章是要扣分的。
摩托车也属于机动车，驾驶摩托车上路的应当依法取得相应的机动车驾驶证，驾驶证的满分为12分，依据道路交通安全违法行为的严重程度，一次记分的分值为：
12分、6分、3分、2分、1分五种。

《中华人民共和国道路交通安全法》第二十四条
公安机关交通管理部门对机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的行为，除依法给予行政处罚外，实行累积记分制度。
公安机关交通管理部门对累积记分达到规定分值的机动车驾驶人，扣留机动车驾驶证，对其进行道路交通安全法律、法规教育，重新考试；
考试合格的，发还其机动车驾驶证。