分居协议的有效性通常受到其是否遵循既定法律规定及双方当事人真实意向之影响。
倘若该份协议系由两个协议签署方充分理解并认同以后进行签订，协议条款亦未违背法律法规的强制性规定或侵害到国家、集体以及其他无辜第三者的合法权益，则这类协议普遍将被视为具有有效性。
举例来说，若在协议中对于财产分配、未成年子女抚养等关键议题作出了公正合理、表达清晰的约定，并且这些约定均出自于双方真实的意思表示，那么它们便有可能获得法律的认可与支持。

《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。