是否有法律效力要视具体情况而定：
1、如果是由代理人在代理权限内代替签字的；
或当事人明知他人以自己名义在合作协议上签字而不作否认表示的，则签字有效，合作协议也有效。
2、如果是是他人在无权代理、超越代理权或者代理权终止后的情况下代替当事人签字的，经当事人追认后，该代理签字有效，合作协议也就有效。
3、如果不属于上述情形的，则所签合作协议无效，对当事人没有法律约束力。

《民法典》第一百六十一条
民事主体可以通过代理人实施民事法律行为。
依照法律规定、当事人约定或者民事法律行为的性质,应当由本人亲自实施的民事法律行为,不得代理。
第一百七十一条
行为人没有代理权、超越代理权或者代理权终止后,仍然实施代理行为,未经被代理人追认的,对被代理人不发生效力。
相对人可以催告被代理人自收到通知之日起三十日内予以追认。被代理人未作表示的,视为拒绝追认。行为人实施的行为被追认前,善意相对人有撤销的权利。撤销应当以通知的方式作出。
行为人实施的行为未被追认的,善意相对人有权请求行为人履行债务或者就其受到的损害请求行为人赔偿。但是,赔偿的范围不得超过被代理人追认时相对人所能获得的利益。
相对人知道或者应当知道行为人无权代理的,相对人和行为人按照各自的过错承担责任。