公司债权债务清理的问题主要有：
债务人采用分立经营的模式、利用市场优势地位迫使供应商压低身价进行合作、采用各种理由推托付款责任等；
债权人选择客户存在失误、忽略法律上的关键问题、债权疏于管理、清收债权的方式不科学、对于债权存在的风险问题防范不够等。

《公司法》第一百八十四条
清算组在清算期间行使下列职权：
（一）清理公司财产，分别编制资产负债表和财产清单；
（二）通知、公告债权人；
（三）处理与清算有关的公司未了结的业务；
（四）清缴所欠税款以及清算过程中产生的税款；
（五）清理债权、债务；
（六）处理公司清偿债务后的剩余财产；
（七）代表公司参与民事诉讼活动。