原则上来说，即使借条上未留存借款人指纹，其依然具备合法效应。
作为体现债权人与债务人之间债权债务关系的书面凭据，其有效性主要依赖于双方是否达成了真实可信的借贷协议以及实际支付款项的事实。
只要借条所载明的借款金额、借款日期、还款期限、借款目的及借款人与出借人的个人资料等关键信息清晰明确，且为双方真实意愿的表达，那么即便借条上并无借款人的指纹，亦不会对其法律效力产生实质性的影响。

《中华人民共和国民法典》第六百六十八条
借款合同应当采用书面形式，但是自然人之间借款另有约定的除外。
借款合同的内容一般包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。