针对未办理结婚登记手续而引发的子女监护权纠纷问题，司法部门通常会站在有利于未成年人身体与心理健康发展，以及维护他们合法权益的立场上，全面审视并权衡双方当事人的抚养能力、抚养环境、孩子的年龄段及个人意愿等多方面因素，从而做出公正合理的裁决。
若子女仍处于哺乳阶段，那么法院往往倾向于将监护权判归母亲所有；
倘若孩子已经具备了一定的认知能力，那么他或她的个人意愿亦将成为重要的考量因素之一。
在双方当事人的抚养条件相差无几的情况下，法院可能会依据更加有利于孩子未来成长的原则进行判决。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。