一、离婚手续办理流程差异较大。
选择到民政部门协商离婚无疑具备诸多优势，只需在双方均取得一致共识之后，便能随时凭借签署好的离婚协议领取离婚证书。
然而，若采用法院调解的方式来完成离婚过程，其程序不仅相对复杂繁琐，需要经历立案、庭审以及最终判决等环节。
二、经济花费有异。
相较而言，依靠民政部门协商离婚所需缴纳的费用明显降低，而由法院进行调解结案的情形下，若双方无共有资产需要分割，仅需支付50元的诉讼费；
假如涉及到资产分割问题，需要根据财产标的额按比例支付相应的诉讼费用。
三、协议执行效用各异。
在协议履行层面上，尽管民政部门备案的离婚协议具有法律效力，却并不具备直接的强制执行力。
在其中一方未能及时履行协议条款的情况下，另一方必须寻求司法途径另行提起诉讼加以解决。
同时，值得注意的是，这份已签订的协议并非能够百分百地获得法律的保障与支持。
一旦出现争议纠纷，仍然需要经过法院裁决认定，故存在着相当程度的风险和不确定性。
通过法院调解达成的协议离婚，会有法院出具的调解书作为凭据，因此具备了强力的强制执行力。
四、协议内容审核要求不同。
从协议具体内容上观察，民政部门对于离婚协议的审核力度较为放松，基本上只需由各方当事人心甘情愿自行达成一致即可。

《民法典》第一千零七十八条规定，婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。
对于婚姻案件二审期限是三个月，判决不准离婚和调解和好的离婚案件，判决、调解维持的案件，没有新情况、新理由，原告在六个月内又起诉的，不予受理。