二手房贷款首付款争议可通过协商解决，若协商无果，则可选择诉讼程序进行处理。依照“谁主张谁举证”的原则，主张存在二手房买卖合同关系的一方须承担相应的举证义务，如提供银行转账凭证、房地产交易税费缴纳证明等相关证据材料予以证实。

《仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。《民事诉讼法》第一百二十五条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《民法典》第五百七十七条当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。