首先，关于购房款项逾时支付所涉及的违约责任表明在合同内的情况，依照约定的内容进行计算。商品房销售协议往往依据标准样本进行订立，绝大部分状况下，对于逾期支付购房款项的违约责任都有所规范。比如，如果购房者未能及时支付款项，则需根据延迟支付部分的百分比，以每日千分之五的比例支付赔偿金。在此类情况下，违约金的具体计算方式已经明确，应当严格按照合同约定执行。
其次，若合同中并无关于违约金数额或者计算方式的相关条款，那么就需要按照未支付购房款项的总价值，参考中国人民银行所规定的金融机构收取逾期贷款利息的标准来进行计算。

《关于审理商品房买卖合同纠纷案件的司法解释》第十七条商品房买卖合同没有约定违约金数额或者损失赔偿额计算方法，违约金数额或者损失赔偿额可以参照以下标准确定：逾期付款的，按照未付购房款总额，参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准计算。逾期交付使用房屋的，按照逾期交付使用房屋期间有关主管部门公布或者有资格的房地产评估机构评定的同地段同类房屋租金标准确定。