针对乡村地区房屋建筑存在质量瑕疵问题的处理方式如下所述：
首先，应采取调解及协商的途径解决。基层建筑承包商、人民调解委员会或相关的行政管理部门可担任调解方，在纠纷各方均自愿参与且达成共识的情况下，通过相互协商来解决问题并达成和解。
其次，若双方无法自行达成和解，可以选择申请仲裁。但需注意，仲裁程序的启动条件是双方在签订合同时已明确约定了仲裁条款，或者在事后以书面形式达成了仲裁协议，否则仲裁机构将无法受理此案。
最后，如果质量问题确实源于施工过程中的不当操作，那么您需要掌握确凿的证据以支持您的主张。

《最高人民法院关于审理商品房买卖合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十条因房屋质量问题严重影响正常居住使用，买受人请求解除合同和赔偿损失的，应予支持。交付使用的房屋存在质量问题，在保修期内，出卖人应当承担修复责任；出卖人拒绝修复或者在合理期限内拖延修复的，买受人可以自行或者委托他人修复。修复费用及修复期间造成的其他损失由出卖人承担。