在处理商业纠纷案件中，其法律诉讼程序通常包括以下几个阶段：提起诉讼请求、法院予以受理、进行法庭审理以及最终做出裁决判决。对于涉及合同方面的争议，双方当事人均可依法向具有管辖权的法院提出诉讼，通过合法途径维护自身权益。如若争议标的金额未超过人民币1万元，则每件案子仅需缴纳50元的立案费用；若超过1万元但不足10万元，则超出部分按比例2.5%缴纳；若超过10万元但不足20万元，则超出部分按比例2%缴纳；以此类推，直至争议标的金额达到或超过人民币200万元时，超出部分按比例0.9%缴纳。

《诉讼费用交纳办法》第十三条案件受理费分别按照下列标准交纳：（一）财产案件根据诉讼请求的金额或者价额，按照下列比例分段累计交纳：1、不超过1万元的，每件交纳50元；2、超过1万元至10万元的部分，按照2、5%交纳；3、超过10万元至20万元的部分，按照2%交纳；4、超过20万元至50万元的部分，按照1、5%交纳；5、超过50万元至100万元的部分，按照1%交纳；6、超过100万元至200万元的部分，按照0。9%交纳；7、超过200万元至500万元的部分，按照0。8%交纳；8、超过500万元至1000万元的部分，按照0。7%交纳；9、超过1000万元至2000万元的部分，按照0。6%交纳；10、超过2000万元的部分，按照0。5%交纳。（二）非财产案件按照下列标准交纳：1、离婚案件每件交纳50元至300元。涉及财产分割，财产总额不超过20万元的，不另行交纳；超过20万元的部分，按照0。5%交纳。2、侵害姓名权、名称权、肖像权、名誉权、荣誉权以及其他人格权的案件，每件交纳100元至500元。涉及损害赔偿，赔偿金额不超过5万元的，不另行交纳；超过5万元至10万元的部分，按照1%交纳；超过10万元的部分，按照0。5%交纳。3、其他非财产案件每件交纳50元至100元。（三）知识产权民事案件，没有争议金额或者价额的，每件交纳500元至1000元；有争议金额或者价额的，按照财产案件的标准交纳。（四）劳动争议案件每件交纳10元。（五）行政案件按照下列标准交纳：1、商标、专利、海事行政案件每件交纳100元；2、其他行政案件每件交纳50元。（六）当事人提出案件管辖权异议，异议不成立的，每件交纳50元至100元。省、自治区、直辖市人民政府可以结合本地实际情况在本条第（二）项、第（三）项、第（六）项规定的幅度内制定具体交纳标准。