商品房抵押后的限制有：
（一）抵押期间房屋所有人转让房屋，未通知抵押权人或者并未告知房屋买受人的，转让行为无效；
（二）抵押人出售房屋所得的价款，应当优先向抵押权人偿还所担保的债权或向与抵押权人约定的第三人提存；
（三）抵押人出售房屋所得价款清偿后剩余部分归抵押人所有，不足部分由抵押人继续清偿。

《中华人民共和国民法典》第四百零六条
抵押期间，抵押人可以转让抵押财产。当事人另有约定的，按照其约定。抵押财产转让的，抵押权不受影响。抵押人转让抵押财产的，应当及时通知抵押权人。抵押权人能够证明抵押财产转让可能损害抵押权的，可以请求抵押人将转让所得的价款向抵押权人提前清偿债务或者提存。转让的价款超过债权数额的部分归抵押人所有，不足部分由债务人清偿。
第四百一十三条
抵押财产折价或者拍卖、变卖后，其价款超过债权数额的部分归抵押人所有，不足部分由债务人清偿。