交通事故的三期鉴定费用，通常一开始是由申请进行鉴定的那一方先垫付的。
当鉴定结束后，如果依据鉴定结果，这个费用最终是要由对方来承担的话，那么对方就需要在判决正式生效之后，把这笔费用支付给申请鉴定的那一方。
要是鉴定结果对于双方在责任认定等方面有着极为重要的影响，并且双方对于费用的承担问题存在争议，这种情况下，就可以在诉讼的过程当中向法院提出相关请求，让法院依据具体的实际情况来判定到底由哪一方来承担这个费用。
总而言之，一般的情况就是申请鉴定的那一方先拿出费用，然后后续再根据对责任的认定以及其他相关情况来确定到底最终由谁来承担这笔费用。
比如在一些较为复杂的交通事故案件中，可能双方对于责任的划分各执一词，此时三期鉴定费用的承担就会成为一个关键问题，需要通过法院的判定来解决。
而在一些责任比较明确的事故中，费用的承担也会相应地比较清晰，申请鉴定方先垫付后由对方承担的流程也能顺利进行。

案情回顾:

小朱与小胡发生交通事故。小朱申请三期鉴定并垫付了费用。鉴定结果对事故责任认定影响重大，小朱认为依结果费用应由小胡承担，但小胡不同意。双方对三期鉴定费用承担存在争议，于是小朱向法院起诉请求判定。

案情分析:

1、按照惯例，小朱先垫付三期鉴定费用是正常流程。
2、由于鉴定结果影响责任认定，且双方对费用承担有争议，法院应依据具体情况判定，如事故责任的划分比例等，来确定最终由谁承担该费用。