首先在合同主体方面，行政合同的当事人一方必定是行政主体，另一方是行政管理的相对人。
双方的权利地位是不平等的，是管理与被管理的关系。而民事合同的双方当事人的法律地位是平等的，一方不得将自己的意志强加给另一方。
其次在合同成立的原则方面，行政合同的双方意思表示一致是行政要求前提下的自愿和对等。
而民事合同，充分保护契约自由，必须以当事人双方意思表示一致为前提，任何单位和个人不得干预。
最后在合同的履行、变更或解除方面。由于行政合同双方当事人不具有完全平等的法律地位；
行政机关享有行政优益权，行政机关可以根据国家行政管理的需要，单方依法变更或解除合同，行政管理的相对人则不享有此种权利。
而民事合同，一旦依法成立，对双方当事人都具有法律约束力，当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。

《民法典》第一百一十九条
依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。