1.恢复合同签订前状态：当股权合同被认定无效后，要让相关情况回归到合同签订之前的样子。
这意味着要消除因该合同产生的各种影响，使得各方的权益和义务回到初始状态。
2.返还相关财产：双方需要返还依据此合同所取得的财产。
这里的财产不仅包括股权，还涵盖了股权所对应的收益等。
例如因持有股权而获得的分红等收益，都应予以返还。
3.过错方承担赔偿责任：若一方在合同签订过程中有过错，需赔偿对方因合同无效而遭受的损失。
若双方都存在过错，则各自承担相应的责任，具体责任比例会根据实际情况判定。
4.公司办理相关手续：对于公司来说，如果涉及到股权变更登记等事宜，应依照法律规定办理撤销登记等手续，从而恢复公司股权结构的原状，确保公司的股权架构合法合规。
5.可能涉及法律程序：在处理股权合同无效的过程中，可能会涉及到诉讼等法律程序。
通过法律程序来明确各方的权利和义务，保障各方合法权益。
总之，股权合同无效后的处理要严格依据法律规定，恢复到合同未签订时的法律状态。

案情回顾:

小朱与小李签订股权合同，后该合同被认定无效。争议点在于如何处理合同无效后的一系列事宜，包括是否恢复原状、财产返还、过错赔偿及公司手续办理等。小朱认为应按法律规定处理，小李则心存疑虑。

案情分析:

1、应恢复合同签订前状态，消除合同产生的影响，使双方权益义务回到初始，保障交易的公平性。
2、双方需返还依据合同取得的财产，包括股权及对应收益，如分红等，以维护财产的合法归属。
3、有过错方需承担赔偿责任，若双方均有过错，则按实际情况判定各自责任比例。
4、公司要办理撤销登记等手续，恢复股权结构原状，确保公司运营合法合规。
5、若协商不成，可能涉及诉讼等法律程序，明确各方权利义务。