宅基地双方协议的效力判断需依据不同情况具体分析，以下为你详细阐述：
1.主体合格且符合规定的协议有效：
协议双方必须均为同一集体经济组织成员。
在此基础上，协议内容还需满足一系列要求。
首先，不能违反法律法规的强制性规定，例如土地管理相关法规中对于宅基地使用的明确限制等。
其次，不能损害集体和他人利益，要确保协议的达成不会对集体的整体利益以及其他成员的合法权益造成负面影响。
同时，在符合“一户一宅”政策等前提下，双方对于宅基地的合法流转、使用等方面作出的约定，通常是具有法律效力的。
比如，在不违背政策的情况下，双方约定对宅基地上的附属设施进行合理改造和使用等内容，就是有效的。
2.主体或内容存在问题的协议无效：
若协议一方不是本集体经济组织成员，涉及宅基地买卖等转让行为，一般是无效的。
这是因为宅基地的流转有严格限制，其所有权属于集体，非本集体成员无法取得宅基地使用权。
例如，城市居民购买农村宅基地的协议就是无效的。
另外，若协议内容违反土地利用总体规划等规定，同样不具备法律效力。
比如，协议中约定在宅基地上建设不符合规划的大型工厂等。
总之，判断宅基地双方协议是否有效，需综合多方面因素，依据具体情况确定。

案情回顾:

小朱和小李同为某村集体经济组织成员，签订宅基地协议，约定对宅基地附属设施改造使用。小胡（非本村成员）与小丽签订宅基地买卖协议。小静与他人签协议拟在宅基地建大型工厂，违反土地规划。争议点在于这些协议是否有效。

案情分析:

1、小朱和小李的协议，双方主体合格，且协议内容未违反法律法规强制性规定，未损害集体和他人利益，符合“一户一宅”政策，关于宅基地附属设施改造使用的约定有效。
2、小胡与小丽的协议，因小胡非本集体经济组织成员，涉及宅基地买卖，违反宅基地流转限制，该协议无效。
3、小静签订的协议，因内容违反土地利用总体规划，不具备法律效力。