店铺转让合同协议在商业活动中有着重要的地位，通常是具有法律效力的。
这是因为，当合同满足一系列法律规定的要件时，就会受到法律的保护。
比如说，双方必须都具备相应的民事行为能力，能够清楚地知晓自己的行为所带来的后果；
意思表示要真实，不能存在虚假或误导的情况；
内容也不能违反法律法规的强制性规定，比如不能转让违法经营的店铺等。
在签订店铺转让合同协议时，有一些重要的条款是必须明确的。
比如要详细说明转让的店铺的具体信息，包括店铺的地址、面积、经营证照等；
转让价格及支付方式也要清晰约定，避免后续出现纠纷；
相关债权债务的处理也不能含糊，要明确责任归属；
还有违约责任，要规定清楚双方在违约情况下应承担的后果。
如果在合同履行过程中出现了纠纷，双方可以依据合同约定的方式来解决，比如先尝试协商，协商不成可以通过调解、仲裁或诉讼等途径。
不过需要注意的是，如果合同存在欺诈、胁迫等情况，导致意思表示不真实，或者违反了法律法规的强制性规定，那么合同可能会无效或者部分无效，这样就无法保障双方的合法权益了。
所以，在签订店铺转让合同协议之前，一定要仔细审查合同条款，确保其合规性和合理性，以避免不必要的风险。