住院发票丢失的，可以通过以下方法处理：
1.发票丢失了是可以补的，只要拿出医疗保险卡就行。
2.记得发票编号的，可以去医院补打发票，去医院出示医疗保险卡以及身份证。
3.可以弄加盖医院印章的发票存根复印件。

《医疗收费票据使用管理办法》第二十三条
医疗机构取得门诊医疗收入和住院医疗收入，应当向付款方开具医疗收费票据，并加盖本单位财务章或收费专用章。医疗机构不开具医疗收费票据的，付款方有权拒绝支付款项。