根据《民法典》的相关规定，动产物权的设立与转让，其效力的产生时间是在交付之时。
这意味着，当你已经将汽车交付给对方后，从物权的角度来看，你就不再是该车辆的所有权人了。
倘若对方不愿意配合办理车辆过户手续，你首先应该与对方进行友好协商，诚恳地要求其履行过户的义务，并妥善保存好协商过程中的相关记录，这些记录将在后续可能的法律程序中起到重要的证明作用。
要是协商的结果并不理想，你可以通过向法院提起诉讼的方式来解决问题。
在诉讼过程中，你需要提供充分的证据，
当法院做出判决后，如果对方仍然不履行过户的义务，你可以向法院申请强制执行。
法院将会介入，通过法定程序强制对方办理过户手续，以确保你的合法权益得到切实的维护。
总之，为了避免不必要的麻烦和损失，你应当尽快采取行动，依据法律规定，积极维护自己对于该车辆的合法权益。

案情回顾:

小朱将汽车交付给小李后，小李却不愿配合办理车辆过户手续，小朱先与小李协商，要求其过户并保存协商记录，协商无果后小朱考虑起诉，争议点在于小李拒绝配合过户，小朱该如何维护自身权益。

案情分析:

1、根据《民法典》，动产物权在交付时转移，小朱交付汽车后，虽物权已转移，但小李有配合过户的义务，其拒绝配合是不合理的。
2、小朱协商时保存记录是正确的，若起诉，购车合同和交付凭证等证据能支持其诉求，若判决后小李仍不履行，申请强制执行可维护小朱权益。