要将宅基地通过遗嘱公证给儿子，可参照以下详细步骤来操作：
一、确认遗嘱人资格
遗嘱人必须是完全民事行为能力人，也就是说，其精神状态正常，能够清晰、准确地表达自己的真实意愿，对自己的行为有明确的认知和判断能力。
同时，宅基地相关权益要清晰无争议。
需要明确的是，宅基地的所有权归集体所有，农户仅拥有使用权。
能通过遗嘱继承的，实际上是宅基地上的房屋等合法财产权益。
比如，宅基地上自建的房屋，这是农户的合法财产，其继承权益是受到法律保护的。
二、准备材料
要准备好一系列相关材料，包括身份证，用于证明遗嘱人的身份信息；户口本，能体现家庭成员关系等情况；宅基地相关权属证明，明确宅基地的使用范围和权益；房屋产权证明，证明宅基地上房屋的产权归属等。
三、申请公证
遗嘱人需亲自前往当地公证机构提出申请。
到达公证机构后，要认真填写公证申请表，在申请表中明确表明将宅基地上房屋等合法财产权益由儿子继承。
四、公证机构审查
公证机构会严谨地对遗嘱人的身份、意思表示的真实性以及相关材料的合法性等方面进行全面审查。
五、出具公证书
经审查，若各项条件均符合要求，公证机构会依照法律规定出具公证书。
值得注意的是，各地公证具体要求和流程或许会存在一定差异。
因此，在办理前，遗嘱人最好先向当地公证机构详细咨询确认，确保准备充分，办理顺利。

案情回顾:

小朱想将自家宅基地通过遗嘱公证给儿子小李，但宅基地相关权益存在争议，其邻居小胡称部分宅基地曾有过使用约定。小朱按流程准备材料、申请公证，公证机构审查时，该争议成为焦点。

案情分析:

1、关于遗嘱人资格，小朱需是完全民事行为能力人，精神正常且能清晰表意，虽宅基地所有权归集体，但自建房屋等合法财产权益可继承。
2、准备材料环节，小朱应确保材料真实完备，以证明身份、权属等。
3、申请公证时，小朱亲自前往，明确表明财产权益由小李继承。
4、公证机构审查严格，小朱与小胡的争议需合理解决，符合条件才会出具公证书。