婚内财产协议修改后签字通常是有效的，下面为你详细说明。
一、有效前提
双方需在平等、自愿基础上对原有财产协议进行修改，并在修改处签字确认。
比如夫妻双方经过充分沟通协商，就某些财产的分配重新达成一致后签字。
二、注意要点
1.符合法律规定：不能违反法律法规的强制性规定。
例如，不能约定将夫妻共同财产用于非法活动等。
2.真实意思表示：不存在欺诈、胁迫等情形。
若一方以欺骗手段让另一方签字修改协议，那么该修改可能无效。
3.特殊财产手续：涉及不动产等需办理变更登记等手续的财产，要及时办理相关手续。
比如房产，修改协议后应按规定到相关部门办理产权变更登记，以保障协议能顺利履行。
总之，只要修改后的婚内财产协议符合法律规定且体现双方真实意思，就是有效的。

案情回顾:

小朱和小丽是夫妻，二人曾签订婚内财产协议。后经协商决定修改协议，小朱在修改处签字，但小丽称签字时小朱有欺诈行为，且协议中涉及房产分配修改后未办理产权变更登记，双方就修改后的协议是否有效产生争议。

案情分析:

1、若小朱不存在欺诈行为，双方是在平等、自愿基础上进行修改并签字确认，那么协议修改在这方面是有效的。
2、若小朱确实存在欺诈，使得小丽在违背真实意思的情况下签字，那么该修改可能无效。
3、对于涉及房产部分，因未办理产权变更登记，可能影响这部分协议修改内容的顺利履行及效力。