在我国，不存在因两地分居达到一定时长，婚姻关系就自动解除的情况。
婚姻关系的解除，有着明确且合法的途径，具体如下：
1.协议离婚：
协议离婚是建立在夫妻双方自愿结束婚姻关系的基础上。
在决定离婚后，双方需要就诸多重要事项进行协商并达成一致意见，这些事项包括子女的抚养问题，比如子女由哪一方直接抚养，另一方的探视权如何安排，抚养费的数额及支付方式等；还有财产的分割问题，像夫妻共同财产如何划分，债务如何分担等。
在协商一致后，双方需签订详细的离婚协议书。
之后，共同前往婚姻登记机关申请离婚登记。
在申请后，会有一个离婚冷静期，目的是给双方一个冷静思考的时间。
冷静期过后，双方需再次亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证，至此，婚姻关系才正式解除。
2.诉讼离婚：
若一方不同意离婚，或者双方对于离婚相关的各项事项无法达成一致意见，那么另一方就可以向人民法院提起离婚诉讼。
其中，因感情不和分居满二年，并且在调解无效的情况下，法院应当准予离婚。
不过，分居时间需要有充分的证据来证明，比如分居协议、租房合同、证人证言等。
同时，法院在判决时，会综合多方面因素判断夫妻感情是否确已破裂，再决定是否判决离婚。

案情回顾:

小朱和小李结婚多年后分居，小朱认为分居达两年婚姻关系自动解除。小李则认为应走法定程序。小朱想协议离婚，小李因财产分割问题不同意；小朱又想诉讼离婚，却不知如何证明分居时间。

案情分析:

1、婚姻关系不会因分居时长自动解除，小朱的认知错误。我国有明确的离婚法定途径，需按规定办理。
2、协议离婚需双方就子女抚养、财产分割等协商一致并签订协议，经离婚冷静期后领离婚证。小李不同意协议离婚，此途径就行不通。
3、诉讼离婚中，小朱需提供充分证据证明分居时间，如分居协议等，法院会综合判断夫妻感情是否破裂来决定是否判离。