通常来讲，旗县的结婚证是可以在市里办理离婚手续的。
依据法律规定，办理离婚登记必须在一方当事人的常住户口所在地的婚姻登记机关进行。
这里所说的常住户口所在地并非仅仅局限于结婚登记的地点。
倘若双方之中有一方的户口在市里，亦或是双方在市里共同居住满了一年，具备了这样的居住条件，那么就能够在市里的婚姻登记机关办理离婚登记。
然而，要是双方无法就离婚相关事宜达成一致意见，此时就需要通过诉讼的方式来办理离婚。
在这种情况下，应当向被告的住所地或者是婚姻缔结地（也就是旗县）的人民法院提起诉讼。
这样的规定是为了确保离婚程序的合法性和公正性，同时也考虑到了不同情况下当事人的实际需求和生活情况。
通过明确这些办理离婚的条件和途径，能够更好地保障当事人的合法权益，让离婚过程更加有序和规范。

案情回顾:

小朱和小李在旗县领取结婚证，后打算离婚。小朱户口在市里，小李认为应回旗县办离婚手续，小朱则认为可以在市里办理，双方为此产生争议。

案情分析:

1、若双方选择协议离婚，依据法律，一方户口在市里或双方在市里共同居住满一年，就可在市里婚姻登记机关办理离婚登记。小朱户口在市里，所以从这点看，是可以在市里办理离婚手续的。
2、若双方无法达成离婚协议需诉讼离婚，此时应向被告住所地或婚姻缔结地（旗县）人民法院提起诉讼，不能随意选择办理地点。