当处于分居两年然后起诉离婚的这种情形时，男方要是没有那些相关的证件，一般来讲是不会对起诉产生什么影响的。
起诉离婚，主要得看婚姻关系的实际情况以及法律上的规定，可不能只盯着特定的证件。
一般来说，是得提供像结婚证这类能证明婚姻关系的材料。
要是结婚证不小心弄丢了，或者实在没办法提供，那也不用着急，去婚姻登记机关开个婚姻关系证明就可以。
分居两年可是离婚的法定事由之一，只要能够有力地证明分居的事实已经持续满两年，法院就会根据这个情况来认定夫妻之间的感情确实已经破裂，然后就会判决离婚。
不过，在诉讼的过程当中，可能会因为证据不够充分之类的情况，导致案件的处理会有一定的难度。
但这可并不意味着就不能起诉离婚。
你完全可以向法院仔仔细细地说明分居的具体情况以及其他相关的事实，然后让法院按照法律规定来进行审理和裁判就好。