农村店铺公证在符合法定条件的情况下是有效的，下面为你做详细阐述：
一、公证的含义
公证是公证机构依据自然人、法人或者其他组织提出的申请，按照法定程序，对民事法律行为、具有法律意义的事实以及文书的真实性和合法性进行证明的一项活动。
例如，在农村店铺的相关事务中，公证机构会对涉及店铺的各种行为和事实进行核实与确认，确保其符合法律规定。
二、农村店铺公证有效性的判断
1.有效情况
若农村店铺的产权清晰明确，比如拥有合法的产权证明文件，这是公证有效的重要基础。
在此前提下，当事人针对店铺的相关交易，如买卖、租赁等，或者对店铺的使用约定等事项向公证机构申请公证，并且公证的整个程序严格遵循《公证法》以及其他相关法律法规的规定，那么这样的公证就是有效的。
比如，店铺所有者与租赁者在签订详细、合法的租赁协议后，通过合法公证程序进行公证，该公证就具备法律效力。
2.无效情况
要是店铺的产权存在争议，例如多人对店铺产权归属有不同主张且尚未明确，或者在公证过程中存在程序违法的情形，像公证人员未按规定核实相关信息等，那么公证的效力就可能会受到影响。
总之，农村店铺公证是否有效需要结合具体实际情况，严格依据相关法律规定来进行判断。

案情回顾:

小朱在农村有一店铺，欲出租给小李。小朱持有合法产权证明，双方签订租赁协议后申请公证。但小胡称该店铺部分产权应归自己，对公证提出异议，争议点在于此公证在有产权争议情况下是否有效。

案情分析:

1、从有效情况看，小朱有合法产权证明，若公证程序严格遵循《公证法》等相关法规，正常情况下该公证应是有效的。因为产权清晰是公证有效的重要基础，双方租赁协议若详细合法，按程序公证具备法律效力。
2、但因小胡提出产权争议，若争议未解决，在产权存在不确定因素时，此公证效力可能受影响。需结合实际，依据法律判断公证是否有效。