如果拆迁安置房被别人住了，可参考以下详细步骤来妥善处理：
一、核实具体情况
首先，要全面且深入地了解居住者入住的真实原因。
这其中可能存在多种情况，比如是因为信息传达有误，导致居住者产生误解，以为自己有居住权；也有可能涉及到复杂的产权纠纷，例如房屋产权界定不清晰，存在争议；或者存在其他一些特殊情况，像原房主与居住者之间有过特殊约定等。
通过与相关方沟通、查阅资料等方式，尽可能掌握准确信息。
二、尝试协商解决
在明确情况后，主动且友好地与居住者进行协商。
在沟通时，要清晰、明确地向居住者表明自己对该房屋拥有合法的权益，并且拿出具有说服力的证明材料，比如拆迁安置协议、房屋产权相关证明等。
诚恳地要求居住者搬离，给对方一个合理的搬离期限。
三、寻求调解协助
若协商未能达到预期效果，可向当地的基层调解组织寻求帮助。
这些组织通常具有丰富的调解经验和专业知识，能够协助双方进行更有效的沟通。
调解过程中，各方可以充分表达自己的诉求和想法，争取和平化解矛盾。
四、借助法律途径
要是调解也无法解决问题，那么可以向人民法院提起诉讼。
在诉讼中，要求居住者停止侵权行为，立即搬离房屋，同时还可根据实际情况主张相应的赔偿。
在此过程中，务必准备好充分、详实的证据，如拆迁安置协议、房屋产权证明等，以有力证明自己对房屋的合法权益。

案情回顾:

小朱的拆迁安置房被小李住了。小朱了解到小李入住是认为原房主与自己有特殊约定，存在产权争议。小朱与小李协商，出示拆迁安置协议要求其搬离，小李拒绝。后经调解无果，矛盾未得到解决。

案情分析:

1、小朱在核实情况时，面对小李认为有特殊约定这一争议，应进一步收集证据证明不存在此约定，明确自身产权。
2、协商阶段，小朱虽出示证明材料，但小李拒绝搬离，说明协商中可能未充分考虑小李想法，未能达成共识。
3、调解无效后，小朱可通过诉讼，凭借拆迁安置协议等证据，要求小李搬离并主张赔偿。