有，棚户区改造房是可以有房产证。但是涉及很多的问题：
1、短期内不能办理。原因多方面，政府主要是考虑不能确权这么多的房子，冲击房地产市场。
2、缴纳税赋不确定。因为负责棚户区改造的房地产是很吃亏的，房地产先投入资金改造棚户区，处在资金链不健全的时候，是不可能负责老百姓这部分的税款的。因为房地产没有销售业绩，没有销售出一套房，但棚户区改造老百姓是要缴纳契税。
3、改造后因此而产生了许多的二套房三套房甚至多套房，政府怎么收这部分房子的税肯定要定高税价，政府也很难定这部分的税赋。
《中华人民共和国城乡规划法(修订)》第六十八条 城乡规划主管部门作出责令停止建设或者限期拆除的决定后，当事人不停止建设或者逾期不拆除的，建设工程所在地县级以上地方人民政府可以责成有关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施。