员工违法，应按照法律规定接受处罚，非因劳动合同明确约定，且该约定不违反法律强制性规定，用人单位无权对员工做罚款处理。
如果员工违法行为损害了公司的合法权益，公司可以对此员工提起诉讼，要求其赔偿损失。
提起诉讼的条件有：
起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
(二)有明确的被告；
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由；
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。
若员工违法导致劳动合同解除事由出现，公司可以通过法定程序解除劳动合同。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十九条
起诉必须符合下列条件：
(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
(二)有明确的被告；
(三)有具体的诉讼请求和事实、理由；
(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。