当企业由于种种原因申请破产后，虽然民间借贷债务仍然需要依法偿还，然而在此过程中，其清偿过程将会根据法律所明确的清偿顺序来执行。
如果该破产企业在扣除破产费用、共同受益债务以及员工工资等多种费用后依然有剩余资产，那么这些剩余资产将会被用来偿还民间借贷债务。
然而，若破产财产无法覆盖所有债务，那么未得到清偿的那部分债务将依据法律规定予以豁免，无需再承担还款责任。

《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条
破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后,依照下列顺序清偿:
(一)破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用,所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用,以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金;
(二)破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款;
(三)普通破产债权。
破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的,按照比例分配。
破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。