股权转让未办理工商变更登记是有效的。
股权转让协议，如系双方当事人真实意思表示，且内容并未违反法律规定，即合法有效，双方当事人均应依约严格履行。未进行工商变更手续，并不影响合同的效力。
股东变更登记其实只是工商部门对公司进行的一种工商行政管理行为，它本身只具有确认股权转让的功能，而不决定股权转让是否有效。工商登记只是种对外公示的行为，起到对抗公司以外的第三人的效力。
综上所述，工商变更登记与否不影响股权转让的效力。

《公司登记管理条例》第34条规定：有限责任公司变更股东的，应当自变更之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。有限责任公司的自然人股东死亡后，其合法继承人继承股东资格的，公司应当依照前款规定申请变更登记。