刑事案件证据不足会根据情况分别进行处理：
1、在侦查阶段，证据不足的，会直接撤销案件；
2、在检察院审查起诉阶段，证据部足的，检察院会做不起诉处理；
3、在法院审判阶段，证据不足的，法院可以判处无罪。

《刑事诉讼法》第一百六十二条
公安机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定;同时将案件移送情况告知犯罪嫌疑人及其辩护律师。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定《刑事诉讼法》第一百七十八条
不起诉的决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。