羁押期满案件尚未办结时，是否会起诉需要根据具体情况来判断。
一般来说，如果案件事实清楚、证据确凿，即使羁押期满，司法机关也会按照法定程序进行起诉。
因为司法机关的职责是维护法律的公正和权威，对于已经构成犯罪的行为，必须依法追究刑事责任。
然而，如果在羁押期满后，发现案件存在证据不足、法律适用问题或者其他需要进一步调查核实的情况，司法机关可能会决定延期起诉或者终止起诉。
这是为了确保起诉的准确性和公正性，避免对无辜的人进行起诉。
此外，不同类型的案件在羁押期满后的处理方式也可能有所不同。
例如，一些轻微的刑事案件可能会采取取保候审等非羁押性强制措施，待案件进一步调查后再决定是否起诉；
而一些重大的刑事案件则可能会继续羁押，直到案件办结。
总之，羁押期满案件尚未办结时是否会起诉，需要综合考虑案件的具体情况、证据的充分性以及法律的规定等因素。
司法机关会根据实际情况做出合理的决定，以确保法律的公正和当事人的合法权益。