刑事拘留案件结束后，其是否残留案底，这主要取决于该案件的最终处理结论。
若在警方深入调查后，犯罪嫌疑人均被判定为有罪，并且随后受到了刑事惩罚，那么在这种情况下，案底便会自然生成。
然而，若刑事拘留案件结束后，经调查证实被告人并未构成犯罪，或者相关案件因各种原因被撤回起诉，那么通常情况下，案底是不会被记录下来的。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条
【依法不追诉原则】有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。