对于环保案件的立案流程，一般情况下所包含的重要环节可以总结为以下四个大步骤：第一步，当涉及到涉嫌违反环保法律法规的行为或者事件被相关部门或个人察觉之后，他们应当向具有相应管辖权限的环境保护主管部门或者其他执法机构进行举报或者投诉；
第二步，当执法机构接收到举报或者投诉之后，将会对这些线索进行初步的审查工作，其中包括了对相关证据资料的搜集以及核实等方面的工作；
第三步，经过审查确认存在违法犯罪嫌疑且满足立案标准的情况下，执法机构将正式启动立案程序，同时也会指定案件的具体承办人员；
最后一步，在立案过程中，执法机构还需对案件进行详细的登记和编排号码，并且建立起完整的案件档案。

《环境保护行政处罚办法》第二十二条
环境保护主管部门对涉嫌违反环境保护法律、法规和规章的违法行为，应当进行初步审查，并在7个工作日内决定是否立案。经审查，符合下列四项条件的，予以立案：（一）有涉嫌违反环境保护法律、法规和规章的行为；（二）依法应当或者可以给予行政处罚；（三）属于本机关管辖；（四）违法行为发生之日起到被发现之日止未超过2年，法律另有规定的除外。违法行为处于连续或继续状态的，从行为终了之日起计算。