关于强奸罪行被判处长达十二年的有期徒刑能否成功申请减刑三年，这需要我们从多个角度进行评估和分析。
通常情况下，对于那些被判处有期徒刑的罪犯而言，他们在执行刑罚的过程中，如果能够严格遵守监狱的规定，积极接受教育改造，表现出真实而深刻的忏悔之情，或是展现出某些立功表现的话，这些都将有助于他们申请得到相应的刑期减免；
若能够展现出重大立功表现，那么动议减刑的可能性将会更加显著。
然而，在此我们还需明确一点，便是减刑之后，罪犯实际执行的刑期不得低于原审判决刑期的二分之一。
换句，即使罪犯在服刑期间积极改变犯罪行为，展现出立功等优秀行为表现，也并不意味着他一定能够成功申请到三年的减刑。
这个问题的最终答案，仍然取决于监狱管理机构基于罪犯现实表现所提出的减刑建议，以及法院依据相关法律法规的裁决。

《中华人民共和国刑法》第七十八条
【适用条件与限度】被判处管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑的犯罪分子，在执行期间，如果认真遵守监规，接受教育改造，确有悔改表现的，或者有立功表现的，可以减刑；有下列重大立功表现之一的，应当减刑：
(一)阻止他人重大犯罪活动的；
(二)检举监狱内外重大犯罪活动，经查证属实的；
(三)有发明创造或者重大技术革新的；
(四)在日常生产、生活中舍己救人的；
(五)在抗御自然灾害或者排除重大事故中，有突出表现的；
(六)对国家和社会有其他重大贡献的。
减刑以后实际执行的刑期不能少于下列期限：
(一)判处管制、拘役、有期徒刑的，不能少于原判刑期的二分之一；
(二)判处无期徒刑的，不能少于十三年；
(三)人民法院依照本法第五十条第二款规定限制减刑的死刑缓期执行的犯罪分子，缓期执行期满后依法减为无期徒刑的，不能少于二十五年，缓期执行期满后依法减为二十五年有期徒刑的，不能少于二十年。