在犯有强奸罪并被指控证据不足的情况下，可以采取以下几种措施进行辩护与翻供：
首先，被告人享有向上一级人民法院提交书面上诉状或口头上诉的权利，对于判决结果表示不服的，上诉期限为自接到判决书之日起计算，共计十日；
其次，被告方也可选择向审判法院或者检察机关提出申诉，以寻求通过合法途径撤销原判，重新审理案件。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百二十七条
被告人、自诉人和他们的法定代理人，不服地方各级人民法院第一审的判决、裁定，有权用书状或者口头向上一级人民法院上诉。被告人的辩护人和近亲属，经被告人同意，可以提出上诉。附带民事诉讼的当事人和他们的法定代理人，可以对地方各级人民法院第一审的判决、裁定中的附带民事诉讼部分，提出上诉。对被告人的上诉权，不得以任何借口加以剥夺。
第二百三十条
不服判决的上诉和抗诉的期限为十日，不服裁定的上诉和抗诉的期限为五日，从接到判决书、裁定书的第二日起算。