水库搬迁人头补偿的标准如下：
1、土地补偿费和安置补助费之和为该耕地被征收前三年平均年产值的16倍；
2、其他土地的土地补偿费和安置补偿费、被征收土地上的零星树木、青苗等补偿，由工程所在省、自治区、直辖市制定标准。

《大中型水利水电工程建设征地补偿和移民安置条例》第二十二条
大中型水利水电工程建设征收土地的土地补偿费和安置补助费，实行与铁路等基础设施项目用地同等补偿标准，按照被征收土地所在省、自治区、直辖市规定的标准执行。
被征收土地上的零星树木、青苗等补偿标准，按照被征收土地所在省、自治区、直辖市规定的标准执行。
被征收土地上的附着建筑物按照其原规模、原标准或者恢复原功能的原则补偿；对补偿费用不足以修建基本用房的贫困移民，应当给予适当补助。
使用其他单位或者个人依法使用的国有耕地，参照征收耕地的补偿标准给予补偿；使用未确定给单位或者个人使用的国有未利用地，不予补偿。
移民远迁后，在水库周边淹没线以上属于移民个人所有的零星树木、房屋等应当分别依照本条第二款、第三款规定的标准给予补偿。