法院冻结工资卡单位一般不会知道。法院冻结被执行人的工资卡是需要作出裁定并通知被执行人和申请执行人的。所以只有案件的当事人才会收到法律文书，单位收不到扣划通知书，自然也无从知道员工的工资卡被冻结。除非单位也是案件当事人或者收到了法院的协助执行通知书。

《民事诉讼法》第一百条
人民法院对于可能因当事人一方的行为或者其他原因，使判决难以执行或者造成当事人其他损害的案件，根据对方当事人的申请，可以裁定对其财产进行保全、责令其作出一定行为或者禁止其作出一定行为；当事人没有提出申请的，人民法院在必要时也可以裁定采取保全措施。
人民法院采取保全措施，可以责令申请人提供担保，申请人不提供担保的，裁定驳回申请。
人民法院接受申请后，对情况紧急的，必须在四十八小时内作出裁定；裁定采取保全措施的，应当立即开始执行。