在遇到交通事故且存在二次手术的情况时，通常一开始都是由交强险在规定的责任限额内来进行赔偿。
要是这部分赔偿不够，那就由商业三者险按照保险合同里的约定去赔偿。
要是到最后还是不够的话，那侵权人就得负责赔偿。
像二次手术所产生的费用，像医疗费、误工费、护理费、交通费、营养费等等这些，都得依据实际发生的具体情况来进行赔偿。
对于后续的误工费之类的，得根据二次手术的恢复时间等合理地去确定。
而且，一定要好好地保留好相关的医疗费用凭证、误工证明之类的证据，这样以后要是需要索赔的话就能用得上。
要是双方在赔偿的事情上协商不还可以通过诉讼的途径去解决，然后由法院根据具体的情况来做出判决。
总而言之，就是要把各种因素都综合起来考虑考虑，一定要保证受害人能够得到合理的赔偿，让他们的权益得到切实的保障。