个人与公司签合作协议是否有效取决于该合同是否满足有效合同的法律要件，首先个人与公司签订的协议需要满足行为人具有相应的民事行为能力，其次意思表示需要真实，最后该合同需要不违反法律、行政法法规的强制性规定，不违背公序良俗。

《民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
第一百四十四条无民事行为能力人实施的民事法律行为无效。