分居两年，不一定可以去民政局办离婚证。去民政局离婚需要夫妻双方协商一致；协商不一致的只能通过诉讼离婚。因为感情不和分居两年以上的，法院一般会判决离婚，法院判决不离婚的，又分居满一年以上，再次起诉的，应该判决离婚。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。