关于农村房屋产权纠纷的妥善梳理及处理流程如下：首先，可供选择的方式包括了由相关当事人进行友好磋商以达成纠纷的解决方案；若协商无果，则可以寻求至县级以上地区的人民政府土地管理机关，向其提出申诉，并请求其介入协调处理，由该机构根据具体情况强制有关方面立即终止侵权行为，并且对因此而产生的经济损失负有赔偿之责；倘若通过上述途径依然无法有效解决纠纷纷争，那么最终的选择将是诉诸于民事诉讼程序来加以解决。

《中华人民共和国民法典》第三百五十九条住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。续期费用的缴纳或者减免，依照法律、行政法规办理。非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定;没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规办理。