在遵循房地产登记证书的一般办理流程时，必须严格遵守与开发公司所签署的契约协议中所规定的各项条款。通常情况下，房地产登记证书的办理要在交付房屋之后尽快展开，并且截止期限不应超过两年。如果开发公司未能按时履行合同要求，他们将承担相应的契约违约责任，而具体的补偿方案应当根据契约内容逐一进行详细审查和确认。如果其中涉及到的补偿金额显著低于业主预估，业主有权利通过法律途径申请提高违约金额；如果双方在契约中并没有明确规定违约责任和赔偿数额，那么可以参照现行的法律法规来处理违约金问题，也就是参照中国人民银行对于逾期贷款利息的相关规定进行具体计算。总的来说，目前有四种方法可以有效地解决房地产登记证书逾期办理的问题，它们分别是：与卖方协商、向消费者权益保护组织投诉、向仲裁机构提出申诉以及通过法院提起诉讼等。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。