商品房的交付时间出现逾期，其相应的赔偿金应该依据有关协议中的规定进行核算。赔偿金作为一种预设的违约救济方式，理应由买卖双方遵照现实状况自主协商并达成共识。若双方已经在相关协议中清晰地约定了赔偿金额，那么其中一方若未能如约履约，必定要向另一方直接支付同等金额的赔偿金。假如在协议中仅设定了赔偿金的计算方法，则需首先按照该方法计算出赔偿金的具体数值，然后由违约方按照所得结果向对方支付赔偿金。当违约方在支付赔偿金时，如果他认为所支付的金额过高，超出了其实际损失的30%，但未超过30%，则不能被视为过高；反之，若收取赔偿金的一方认为所收到的金额不足以弥补其实际损失，则可申请仲裁机构或人民法院予以增补，使违约方支付与其损失相当的金额。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；
约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。