棚户区改造房是可以有房产证。但是涉及很多的问题：
1、短期内不能办理。
2、缴纳税赋不确定。
3、改造后因此而产生了许多的二套房三套房甚至多套房，政府怎么收这部分房子的税肯定要定高税价，政府也很难定这部分的税赋。

《民法典》第三百五十条，建设用地使用权人应当合理利用土地，不得改变土地用途；需要改变土地用途的，应当依法经有关行政主管部门批准。