在小产权房屋使用期限届满之后，可采取以下两种方式进行处理：
首先，业主可以选择通过购置该房产来获得大产权证，同时按照规定缴纳相关税费，待期限届满时再支付土地出让金以实现自动续期；
其次，若业主同意将房屋归还给国家，那么他/她将有权领取相应的补偿款项，并有机会再次购买到具备合法产权的全新住房。

《城市房地产管理法》第二十一条
土地使用权出让合同约定的年限届满，土地使用者需要继续使用的，应当至迟于届满前一年申请续期，除根据社会公共利益需要收回该幅土地的，应当予以批准。
续期的，应重新签订土地使用权出让合同，依照规定支付土地使用权出让金。
《民法典》第三百五十九条
住宅建设用地使用权限期间届满的，自动续期。
非住宅建设用地使用权期间届满后的续期，依照法律规定办理。
该土地上的房屋及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。